В отделении проводится лечение больных сахарным диабетом, в основном страдающих 1 типом, а также больных сахарным диабетом 2 типом, инсулинопотребных. Проводится лечение осложнений сахарного диабета - диабетической ретинопатии (совместно с окулистами), диабетической нефропатии (совместно с нефрологами), синдромом диабетической стопы (совместно с неврологами и сосудистыми хирургами). В отделении проводится обучение больных сахарным диабетом (методам самоконтроля). Осуществляется лечение беременных, страдающих сахарным диабетом (совместно с акушер-гинекологами): внедряется новая технология ведения беременных, страдающих сахарным диабетом - установка инсулиновой помпы.

В отделении успешно проводится лечение больных диффузным токсическим зобом (подготовка к хирургическому лечению, совместное с хирургами ведение послеоперационных больных). Разработан и внедрен комплексный метод лечения эндокринной (аутоиммунной) офтальмопатии (применение высоких доз глюкокортикоидов в виде прерывистых  внутривенных инфузий + рентгенотерапия на область орбиты).

Проводится диагностика и лечение заболеваний надпочечников, гипоталамо-гипофизарной системы (болезнь и синдром Иценко-Кушинга, хроническая надпочечниковая недостаточность, феохромоцитома, акромегалия, несахарный диабет), заболеваний околощитовидных желез (гипепаратиреоз, гипопаратиреоз).